Plan gospodarki niskoemisyjnej to dokument, który należy monitorować i aktualizować w odpowiednich odstępach czasowych. Do wykonywania tych czynności zaleca się powołanie odrębnej jednostki w strukturach urzędu lub zespołu osób, które będą nadzorowały realizację zadań wpisanych do PGN.
Do wskaźników monitoringu Planu należy zaliczyć:
- poziom redukcji emisji CO2 w stosunku do lat poprzednich (w tym przypadku do określanego roku bazowego)
- poziom redukcji zużycia energii finalnej w stosunku do przyjętego roku bazowego (tj. poprawa efektywności energetycznej)
- udział zużytej energii pochodzącej ze źródeł odnawialnych.
Monitorowanie postępów PGN odbywa się poprzez sporządzanie rocznych raportów przez jednostkę nadzorującą plan.